Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Adgrv1-202ENSMUST00000109565 7094 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm2788-207ENSMUST00000211055 1078 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Usp20Q8C6M1 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp20Q8C6M1 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms