Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NischQ80TM9 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Olfr1261-204ENSMUST00000216953 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm14998-201ENSMUST00000120502 495 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Vmn2r99-201ENSMUST00000176107 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
NischQ80TM9 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms