Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms