Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Virma-202ENSMUST00000059914 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Plec-205ENSMUST00000073418 15455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Cldn34a-201ENSMUST00000164764 636 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AC123705.4-202ENSMUST00000221602 697 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Ccdc18Q640L5 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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