Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Shank3Q4ACU6 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Mir6907-201ENSMUST00000183764 71 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Myh10-202ENSMUST00000092984 7759 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Kcnj15-203ENSMUST00000113855 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Shank3Q4ACU6 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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