Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Olfr1564-202ENSMUST00000208645 5213 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Atp2b3Q0VF55 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Atp2b3Q0VF55 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms