Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm14613-201ENSMUST00000122239 752 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Cntn3Q07409 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms