Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Irx1P81068 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms