Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Bex6-201ENSMUST00000099990 764 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Scgb2b33-201ENSMUST00000187413 334 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm8861-201ENSMUST00000196346 832 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm11781-201ENSMUST00000118328 472 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Sh3bp1P55194 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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