Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 CT030645.2-201ENSMUST00000224321 1012 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm26340-201ENSMUST00000102365 99 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AA465934-205ENSMUST00000177533 308 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm7351-201ENSMUST00000210745 580 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr291-201ENSMUST00000211582 1159 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms