Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxc11P31313 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 B230118H07Rik-208ENSMUST00000160037 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm33651-201ENSMUST00000200405 456 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hoxc11P31313 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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