Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Dclk1-201ENSMUST00000054237 7847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.08□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Chl1-206ENSMUST00000205098 2464 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Nvl-201ENSMUST00000027797 9392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
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PtprmP28828 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
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PtprmP28828 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
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PtprmP28828 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
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PtprmP28828 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
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PtprmP28828 Osbpl6-202ENSMUST00000111929 8257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Tcrg-C2-201ENSMUST00000103561 914 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PtprmP28828 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
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