Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
RxraP28700 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
RxraP28700 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
RxraP28700 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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