Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Lilrb4a-201ENSMUST00000217706 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hoxd10P28359 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms