Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1508-202ENSMUST00000206520 5791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Carf-209ENSMUST00000187978 5463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Parn-201ENSMUST00000058884 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Zfp518b-201ENSMUST00000057258 6804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm28070-201ENSMUST00000191502 445 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1491-201ENSMUST00000052737 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Frem1-208ENSMUST00000170248 9527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Zfp655-205ENSMUST00000199322 4157 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Srcap-214ENSMUST00000190390 9633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
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