Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PdgfraP26618 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms