Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Lingo2-203ENSMUST00000108122 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm43120-201ENSMUST00000196228 667 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 AC146601.1-201ENSMUST00000227910 905 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Pde6bP23440 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms