Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
H2-M11F6U8V3 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms