Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Adam3-209ENSMUST00000171438 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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