Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28493-201ENSMUST00000188427 604 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms