Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Zfp27-205ENSMUST00000162592 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Ccdc47Q9D024 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Ccdc47Q9D024 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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