Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm13998-201ENSMUST00000120952 335 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1420-203ENSMUST00000217281 2998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rprd1bQ9CSU0 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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