Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Usp27Q8CEG8 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms