Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Rnf149Q3U2C5 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf149Q3U2C5 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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