Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Frmd8os-202ENSMUST00000187697 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms