Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm26984-201ENSMUST00000182345 3510 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm22223-201ENSMUST00000157360 125 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Tas2r143-201ENSMUST00000057398 882 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Rpl28P41105 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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