Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm24300-201ENSMUST00000177809 109 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm24017-201ENSMUST00000178726 109 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm23952-201ENSMUST00000179380 109 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm28665-201ENSMUST00000189269 670 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC107663.1-201ENSMUST00000224257 468 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr664-201ENSMUST00000072887 966 ntAPPRIS P5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr846-202ENSMUST00000214810 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Rrh-201ENSMUST00000029648 1506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Nedd1P33215 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.5 ms