Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PdgfraP26618 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms