Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NefhP19246 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Olfr1385-202ENSMUST00000214948 4412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
NefhP19246 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms