Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Rfpl4-203ENSMUST00000208468 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sptan1P16546 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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