Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm22351-201ENSMUST00000083925 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Klrb1f-201ENSMUST00000032257 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Ccl20O89093 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Ccl20O89093 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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Ccl20O89093 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Ccl20O89093 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Ccl20O89093 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
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