Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm15448-202ENSMUST00000108619 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm17435-201ENSMUST00000181452 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Mecom-204ENSMUST00000166001 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
ScaperF8VQ70 Gm37220-201ENSMUST00000195179 415 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms