Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Clrn2B2RVW2 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm5436-201ENSMUST00000058103 643 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Clrn2B2RVW2 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147 ms