Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Grik3B1AS29 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ighv1-20-201ENSMUST00000103506 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm8282-201ENSMUST00000187559 483 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Grik3B1AS29 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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