Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm2099-201ENSMUST00000220979 412 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC124421.1-201ENSMUST00000219114 4154 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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Col5a3Q9JLI2 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
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Col5a3Q9JLI2 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Col5a3Q9JLI2 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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