Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Olfr1360-203ENSMUST00000216083 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Olfr466-202ENSMUST00000214214 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
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PtprtQ99M80 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
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PtprtQ99M80 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Etl4-206ENSMUST00000114608 6635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
PtprtQ99M80 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
PtprtQ99M80 Dsg1c-201ENSMUST00000054128 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprtQ99M80 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprtQ99M80 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprtQ99M80 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprtQ99M80 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprtQ99M80 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprtQ99M80 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprtQ99M80 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprtQ99M80 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprtQ99M80 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprtQ99M80 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprtQ99M80 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
PtprtQ99M80 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms