Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 AC116319.2-201ENSMUST00000228159 984 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Dsg1cQ7TSF0 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms