Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
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Ccdc18Q640L5 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ccdc18Q640L5 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ccdc18Q640L5 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ccdc18Q640L5 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ccdc18Q640L5 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
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Ccdc18Q640L5 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Ccdc18Q640L5 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
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