Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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Hoxa13Q62424 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC6.77□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Hoxa13Q62424 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms