Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm26563-201ENSMUST00000181003 1704 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rbbp4Q60972 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms