Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 6430710C18Rik-202ENSMUST00000125746 509 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm24157-201ENSMUST00000175265 111 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Sft2d1Q5SSN7 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms