Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm12703-201ENSMUST00000145411 2039 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Snx27Q3UHD6 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms