Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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Cpne9Q1RLL3 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Cpne9Q1RLL3 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Cpne9Q1RLL3 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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Cpne9Q1RLL3 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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Cpne9Q1RLL3 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms