Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm23082-201ENSMUST00000157852 133 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Trim71Q1PSW8 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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