Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
Traf3ip1Q149C2 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Traf3ip1Q149C2 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms