Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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Hoxd13P70217 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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Hoxd13P70217 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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Hoxd13P70217 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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Hoxd13P70217 AC174797.2-203ENSMUST00000224017 716 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Hoxd13P70217 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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Hoxd13P70217 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Hspa9-ps1-201ENSMUST00000119602 1933 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Ctnna3-202ENSMUST00000105440 3682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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Hoxd13P70217 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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Hoxd13P70217 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Hoxd13P70217 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Hoxd13P70217 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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