Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm44892-201ENSMUST00000208595 488 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SbdsP70122 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SbdsP70122 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Il19-202ENSMUST00000112465 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Il19-201ENSMUST00000016668 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SbdsP70122 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms