Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
VdrP48281 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm44448-201ENSMUST00000205104 393 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 AC126939.4-201ENSMUST00000225360 743 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
VdrP48281 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Olfr1412-202ENSMUST00000190505 3663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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VdrP48281 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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VdrP48281 H2-Ea-ps-201ENSMUST00000134042 686 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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VdrP48281 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
VdrP48281 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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