Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 1700013A02Rik-201ENSMUST00000202969 645 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RxraP28700 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rps12-ps16-201ENSMUST00000118529 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Serpinb9g-201ENSMUST00000081927 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
RxraP28700 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC6□□□□□ -1.45
RxraP28700 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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