Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm44055-201ENSMUST00000204376 247 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr638-201ENSMUST00000209757 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Eri2-202ENSMUST00000063902 1241 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm18701-201ENSMUST00000188281 1536 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Hoxd9P28357 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
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